Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psma8Q9CWH6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma8Q9CWH6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms