Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NubplQ9CWD8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms