Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc3Q9CW03 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc3Q9CW03 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms