Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MINDY3Q9CV28 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms