Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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