Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpsQ9CQC2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpsQ9CQC2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms