Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp3Q9CQ10 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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