Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms