Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms