Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacsin3Q99JB8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms