Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf112Q96DY5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf112Q96DY5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms