Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN23Q96B33 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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