Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms