Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms