Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna2Q91X60 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna2Q91X60 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms