Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx18Q8VDS8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx18Q8VDS8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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