Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpcsQ8VDG5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpcsQ8VDG5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpcsQ8VDG5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpcsQ8VDG5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpcsQ8VDG5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PpcsQ8VDG5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpcsQ8VDG5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpcsQ8VDG5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpcsQ8VDG5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms