Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd1Q8VCZ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd1Q8VCZ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms