Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5J9

Arl6ip5, PRA1 family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip5Q8R5J9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip5Q8R5J9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip5Q8R5J9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip5Q8R5J9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip5Q8R5J9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip5Q8R5J9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip5Q8R5J9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip5Q8R5J9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip5Q8R5J9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip5Q8R5J9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arl6ip5Q8R5J9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arl6ip5Q8R5J9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms