Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk8Q8R3L8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk8Q8R3L8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms