Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pof1bQ8K4L4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pof1bQ8K4L4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pof1bQ8K4L4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms