Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms