Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms