Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms