Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SbsnQ8CIT9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SbsnQ8CIT9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SbsnQ8CIT9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SbsnQ8CIT9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SbsnQ8CIT9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SbsnQ8CIT9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SbsnQ8CIT9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SbsnQ8CIT9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SbsnQ8CIT9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SbsnQ8CIT9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SbsnQ8CIT9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SbsnQ8CIT9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms