Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms