Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ercc8Q8CFD5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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