Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ClasrpQ8CFC7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClasrpQ8CFC7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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