Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl11Q8CE33 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl11Q8CE33 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms