Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe22Q8C6A8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms