Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sfrp1Q8C4U3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sfrp1Q8C4U3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp1Q8C4U3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp1Q8C4U3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp1Q8C4U3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp1Q8C4U3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp1Q8C4U3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp1Q8C4U3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp1Q8C4U3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms