Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep55Q8BT07 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms