Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjd4Q8BSD4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms