Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra5Q8BHJ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms