Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zer1Q80ZJ6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms