Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aldh3b1Q80VQ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aldh3b1Q80VQ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms