Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Cdc42bpbQ7TT50 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpbQ7TT50 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms