Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms