Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab35Q6PHN9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab35Q6PHN9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms