Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms