Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf1cQ6PDZ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms