Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms