Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms