Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nptx1Q62443 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nptx1Q62443 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms