Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp1Q62442 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms