Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga6Q61739 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga6Q61739 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms