Protein–RNA interactions for Protein: Q61686

Cbx5, Chromobox protein homolog 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx5Q61686 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx5Q61686 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx5Q61686 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms