Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrkQ60976 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrkQ60976 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JrkQ60976 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JrkQ60976 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms