Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbibQ60778 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NfkbibQ60778 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms