Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stxbp3Q60770 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stxbp3Q60770 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms